Η κύρια επιπλοκή της κολπικής μαρμαρυγής είναι η εμφάνιση εγκεφαλικού επεισοδίου. Κύριος θεραπευτικός στόχος είναι η προστασία των ασθενών από την εμφάνιση εγκεφαλικού επεισοδίου με χορήγηση αντιπηκτικών φαρμάκων.
Όμως ο κίνδυνος εγκεφαλικού επεισοδίου ποικίλλει μεταξύ των ασθενών με κολπική μαρμαρυγή. Κατά συνέπεια η ένδειξη θεραπείας με αντιπηκτικά κρίνεται κατά περίπτωση από το θεράποντα καρδιολόγο μετά από συνεκτίμηση συγκεκριμένων παραγόντων κινδύνου κάθε ασθενή.

Στόχος της κατάλυσης είναι η ελάττωση ή και η εξάλειψη των επεισοδίων κολπικής μαρμαρυγής. Η πιθανότητα εξάλειψης της κολπικής μαρμαρυγής μετά από επέμβαση κατάλυσης εξαρτάται από τον τύπο της κολπικής μαρμαρυγής (παροξυσμική ή εμμένουσα) και από τα χαρακτηριστικά του ασθενή (ηλικία, συνυπάρχουσες παθήσεις, διάμετρος αριστερού κόλπου κλπ). Συνήθως η πιθανότητα εξάλειψης της παροξυσμικής κολπικής μαρμαρυγής μετά από πρώτη επέμβαση είναι περίπου 70%. Ακόμη όμως και σε περίπτωση που δεν επιτευχθεί εξάλειψη, οι ασθενείς θα παρουσιάσουν ελάττωση της διάρκειας και του αριθμού των υποτροπών (μείωση του φορτίου της αρρυθμίας).

Η διάρκεια της επέμβασης κατάλυσης εξαρτάται από το είδος της τεχνικής που θα χρησιμοποιηθεί. Η μέση διάρκεια είναι περίπου 60 με 90 λεπτά. Σε ορισμένες περιπτώσεις, με χρήση ειδικών καθετήρων κατάλυσης (single-shot ablation), η διάρκεια της επέμβασης μειώνεται και σε λιγότερο από 60 λεπτά. Εντούτοις, ο στόχος δεν είναι η ταχύτερη αλλά η πλέον ορθή και ποιοτική επέμβαση η οποία θα εξασφαλίσει βελτίωση της συμπτωματολογίας του ασθενή και ελάττωση ή ακόμη εξάλειψη της κολπικής μαρμαρυγής.